Han sido desarrolladas estratégicamente para aglutinar instalaciones punteras y facilitar investigación pionera con masa crítica en ámbitos específicos. Las plataformas ofrecen también servicios avanzados para investigadores académicos o privados.

• Genotipado: La Plataforma de Genotipado está construida en torno a CIC bioGUNE (coordinador de plataforma), y ofrece las más avanzadas tecnologías a la comunidad internacional. Esta plataforma se ha utilizado, por ejemplo, para estudiar la variedad haplotípica de la población autóctona vasca y compararla con otras descritas por el consorcio HapMap (http://www.hapmap.org). Otros proyectos están estudiando la asociación de SNP con enfermedades o la influencia de la genética en la diabetes mellitus de tipo I, esclerosis múltiple, NASH o Alzheimer. Las posibilidades de Genómica Funcional y el estudio de la función de los genes a gran escala se completan con una Plataforma de Silenciamiento Génico basada en torno a la influencia del RNA, modelos animales y líneas celulares.

• Biología Estructural: La Plataforma de Biología Estructural de CIC bioGUNE es una instalación puntera y está dotada de Resonancia Magnética Nuclear, Microscopía Electrónica y Difracción de Rayos X. Se encuentra a disposición de la comunidad científica y empresarial y permite estudiar complejos de proteínas, observar motores moleculares o mejorar las características de enzimas interesantes desde el punto de vista comercial.

• Imagen Molecular: Plataforma singular que incluye capacidades de SPECT, PET, MRI y fluorescencia y emplea animales pequeños, y cuyas actividades se centran sobre todo en el desarrollo de nuevas técnicas de imagen para analizar dispositivos de administración de fármacos controlados, tratamientos dirigidos, y técnicas de comparación de diagnóstico, entre otras aplicaciones. Ubicada en CIC biomaGUNE, está plenamente operativa desde 2009.

• Biobanco: pieza clave para la investigación biomédica, que integra muestras del sistema de salud y la UPV/EHU y que está complementado con el Centro Vasco de Sangre, bases de datos de la población, estadísticas y estudios epidemiológicos. El biobanco está organizado en torno a diferentes tipos de muestras (DNA, tumores, células y tejidos, etc.) y a un singular Banco de Cerebros (en UPV/EHU), uno de los 8 dedicados a investigación en Europa y Estados Unidos.